CSEE 2017 Victoria

Geneviève,  Isabelle and Steve presented their research at the 2017 Canadian Society for Ecology & Evolution annual meeting in beautiful Victoria. Looking forward to next year’s meeting in Guelph!

Postdoctoral position available

Postdoctoral Project

Drought, plant nutrition, and the microbial ecology of Quebec forests

Global change is projected to lead to temperature increases and modifications in precipitation regimes in Quebec forests, which may lead to increased drought stress and changes in tree growth and regeneration and forest productivity.

We seek a postdoctoral researcher to participate in an experiment established in 2014 in the Forêt Montmorency in Quebec where trees have been exposed to different degrees of drought stress to simulate potential changes in precipitation due to global change. The postdoctoral researcher will use an experimental plantation of more than 2000 tree seedlings to study the interaction among different degrees of drought stress, tree nutrition and the microbial communities associated with trees and soils. The candidate will carry out work in the field (sampling at the field site) and in the laboratory (quantification and analysis of microbial communities using high-throughput sequencing approaches).

The project represents a collaboration between the Université du Québec à Montréal (UQAM), the Quebec Ministry of Forests, Wildlife, and Parks (MFFP), and the Ouranos climate change consortium. The candidate will be supervised by Dr. Steven Kembel (UQAM) and Dr. Daniel Houle (MFFP / Ouranos).

Qualifications

  • Ph.D. in Biology, Ecology, Forestry, Microbiology, or related fields
  • Excellent motivation and publication record
  • Expertise in methods for microbial community ecology
    (e.g. high-throughput 16S sequencing, metagenomic sequencing, multivariate analysis)
  • Expertise in plant ecology / ecophysiology / plant microbiomes an asset

The anticipated start date will be the summer or autumn of 2017. Funding is guaranteed for one year.

Interested candidates should send a cover letter, CV, and the name of two references to Steven Kembel (kembel.steven_w@uqam.ca) and Daniel Houle (daniel.houle@mffp.gouv.qc.ca).

 

Projet de Post Doctorat

Analyse de la vulnérabilité de la forêt québécoise aux sécheresses : impacts sur la nutrition et les communautés microbiennes

Partout dans le monde, il y a une augmentation des préoccupations concernant les impacts des sécheresses sur le capital forestier. Dans l’est du Canada, les modèles climatiques projettent une augmentation de la température de 3-5 °C pendant la saison de croissance alors que les précipitations devraient demeurer passablement stables. Ces conditions pourraient mener à une diminution moyenne de 20 à 40% du contenu en eau des sols forestiers du Québec pendant la saison de croissance. En outre, la fréquence et l’intensité des sécheresses sont appelées à augmenter. Dans ce contexte, il est essentiel de quantifier les impacts des sécheresses sur la productivité de la forêt en général et plus particulièrement sur la régénération.

Un dispositif d’exclusion des précipitations a été mis en place à l’été 2014 en forêt boréale, dans la Forêt Montmorency (Parc des Laurentides). Le candidat utilisera ce dispositif, comprenant plus de 2000 semis de 4 espèces différentes, pour comparer l’impact de différents degrés d’exclusion de précipitations sur la nutrition des semis et les communautés microbiennes dans les sols et la phyllosphère. Le candidat sera appelé à travailler sur le terrain (échantillonnage sur le site expérimental) et en laboratoire. En outre, le candidat pourra être appelé à traiter des données déjà obtenues concernant l’effet d’ajouts d’azote in situ sur les communautés microbiennes de la phyllosphère.

Ce projet est le fruit d’une collaboration entre l’Université du Québec à Montréal, le ministère des Forêts, de la Faune et des Parcs, et le consortium sur les changements climatiques Ouranos.

Profil du (de la) candidat (e) recherché (e) : Doctorat en biologie, écologie forestière, microbiologie (ou autre discipline connexe), bon dossier académique, grande motivation. Connaissances en méthodes pour la quantification et l’analyse bioinformatique des communautés microbiennes (p. ex. séquençage 16S). Des connaissances en écologie des plantes et écophysiologie seraient un atout.

Début du projet : Juin 2017

Financement garantie pour un an.

Superviseurs : Steven Kembel (UQAM) et Daniel Houle (MFFP et Ouranos)

Faire parvenir une lettre de motivation, un CV complet, et les noms de deux références aux adresses suivantes :

kembel.steven_w@uqam.ca et daniel.houle@mffp.gouv.qc.ca

Fall 2016 lab news

Wow, an update is long overdue! Lots of exciting news from the lab during the past months. A few highlights :

  • Jessica Wallace successfully defended her MSc on sugar maple microbiomes
  • Isabelle Laforest-Lapointe presented her work at ISME2016 and ESA and published several papers from her PhD project
  • Cédric Boué, Geneviève Lajoie, Remi Maglione and Mona Parizadeh joined the lab

R for Biodiversity Analysis Workshop files

Over the past few years I have taught a one-day workshop on the use of the R statistical software for the analysis of biodiversity data.

Typically I spend a half day giving a general introduction to R and a half day working through some examples of how to use R to analyze ecological and evolutionary data sets.

The files used for the workshop, including data sets and R code, are publicly available and have moved to a new location:

http://kembellab.ca/r-workshop/

Enjoy!

La diversité microbienne sur les feuilles tropicales

On a publié un article dans PNAS sur l’écologie des bactéries sur les feuilles tropicales:

Actualités UQAM : Arbres et communautés bacteriennes

S.W. Kembel, T.K. O’Connor, H.K. Arnold, S.P. Hubbell, S.J. Wright, and J.L. Green. 2014. Relationships between phyllosphere bacterial communities and plant functional traits in a neotropical forest. Proceedings of the National Academy of Sciences of the U.S.A. 38:13715-13720.

Lab website update

The lab website has been updated, and we’ve moved to a new domain at kembellab.ca.

Thanks to Cam Webb for hosting us at phylodiversity.net for so many years. Content from the old site at phylodiversity.net/skembel will be migrated to the new site shortly.